Jornada 1 - 4 al 6 de Enero de 2013
León vs Querétaro
Jornada 2 - 11 al 13 de Enero de 2013
Querétaro vs UNAM
Jornada 3 - 18 al 20 de Enero de 2013
Pachuca vs Querétaro
Jornada 4 - 25 al 27 de Enero de 2013
Querétaro vs Tigres
Jornada 5 - 1 al 3 de Febrero de 2013
América vs Querétaro
Jornada 6 - 8 al 10 de Febrero de 2013
Querétaro vs Chiapas
Jornada 7 - 15 al 17 de Febrero de 2013
Atlante vs Querétaro
Jornada 8 - 22 al 24 de Febrero de 2013
Querétaro vs Atlas
Jornada 9 - 1 al 3 de Marzo de 2013
Querétaro vs Monterrey
Jornada 10 - 8 al 10 de Marzo de 2013
Tijuana vs Querétaro
Jornada 11 - 15 al 17 de Marzo de 2013
Querétaro vs Toluca
Jornada 12 - 29 al 31 de Marzo de 2013
Santos vs Querétaro
Jornada 13 - 5 al 7 de Abril de 2013
Querétaro vs Cruz Azul
Jornada 14 - 12 al 14 de Abril de 2013
Morelia vs Querétaro
Jornada 15 - 19 al 21 de Abril de 2013
Querétaro vs San Luis
Jornada 16 - 26 al 28 de Abril de 2013
Guadalajara vs Querétaro
Jornada 17 - 3 al 5 de Mayo de 2013
Querétaro vs Puebla